Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.513e-15■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-15■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 513.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 RPL3-215ENST00000481985 557 ntTSL 212.57□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.55e-11■■■■■ 39.9
EFTUD2Q15029 PRPF31-207ENST00000466404 1837 ntTSL 219.12■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 422.21■■□□□ 1.153e-9■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 GIGYF1-204ENST00000472105 500 ntTSL 318.71■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.784e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.564e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 TMEM55B-207ENST00000557041 3453 ntTSL 216.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 ZNF37A-205ENST00000498773 471 ntTSL 314.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 210.69□□□□□ -0.76e-8■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 FANCG-202ENST00000425676 2108 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 PGS1-213ENST00000589689 1168 ntTSL 216.76■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 PGS1-215ENST00000592043 988 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 IFT172-211ENST00000476693 517 ntTSL 55.98□□□□□ -1.459e-9■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 NDUFS8-203ENST00000453471 620 ntTSL 315.32■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 39.8
EFTUD2Q15029 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.966e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 MOGS-204ENST00000448666 1616 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 MOGS-207ENST00000462443 532 ntTSL 217.3■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 MOGS-203ENST00000414701 520 ntTSL 313.86□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 LENG8-207ENST00000462541 456 ntTSL 29.79□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 AATK-202ENST00000374792 4938 ntTSL 220.56■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 INCENP-203ENST00000528037 1372 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 ATP8B3-205ENST00000531925 5237 ntTSL 218.66■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 ATP8B3-207ENST00000533993 882 ntTSL 312.56□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 ATP8B3-203ENST00000526092 2759 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 511.15□□□□□ -0.623e-9■■■■■ 39.7
EFTUD2Q15029 ITGA5-208ENST00000551861 536 ntTSL 410.29□□□□□ -0.767e-14■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 STRN4-216ENST00000598074 448 ntTSL 413.57□□□□□ -0.242e-19■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 IMP4-205ENST00000452955 923 ntTSL 311.17□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 FADS1-211ENST00000536991 2701 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 TM7SF2-223ENST00000533646 486 ntTSL 219.24■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MROH6-203ENST00000529971 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.19■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 323.14■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MIDN-203ENST00000586843 416 ntTSL 220.58■□□□□ 0.898e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 UQCRC1-202ENST00000412343 778 ntTSL 320.17■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-220ENST00000497697 558 ntTSL 219.75■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 POLR3D-204ENST00000518039 1202 ntTSL 218.81■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 UQCRC1-206ENST00000467690 931 ntTSL 218.56■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-207ENST00000426927 574 ntTSL 417.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-211ENST00000440425 599 ntTSL 417.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-216ENST00000475548 598 ntTSL 417.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-217ENST00000482444 589 ntTSL 417.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-214ENST00000596218 897 ntTSL 317.19■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VARS2-207ENST00000476162 2228 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.254e-9■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MDC1-206ENST00000489540 1402 ntTSL 216.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-208ENST00000492498 1156 ntTSL 516.47■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 CAPRIN1-210ENST00000531668 479 ntTSL 316.46■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 POLR3D-205ENST00000519237 683 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 316.27■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 TBC1D10B-206ENST00000490703 1031 ntTSL 315.7■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-210ENST00000438223 545 ntTSL 415.23■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MINK1-206ENST00000572304 559 ntTSL 414.25□□□□□ -0.131e-21■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GALM-205ENST00000444351 834 ntTSL 514.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 TBC1D10B-205ENST00000478158 4614 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MINK1-205ENST00000571526 552 ntTSL 413.32□□□□□ -0.281e-21■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GNL1-202ENST00000433809 1093 ntTSL 213.28□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 313.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 TBC1D10B-202ENST00000464644 694 ntTSL 313.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 512.83□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-206ENST00000422839 566 ntTSL 412.8□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MMS19-219ENST00000495415 1879 ntTSL 512.72□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 UQCRC1-205ENST00000463708 739 ntTSL 312.47□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MMS19-207ENST00000434538 2164 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 39.6
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1860.2 ms