Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms