Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1BQ01064 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms