Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA2P51531 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms