Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NESP48681 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NESP48681 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NESP48681 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
NESP48681 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NESP48681 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NESP48681 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NESP48681 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NESP48681 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NESP48681 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NESP48681 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NESP48681 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NESP48681 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NESP48681 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NESP48681 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NESP48681 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NESP48681 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NESP48681 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NESP48681 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NESP48681 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NESP48681 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NESP48681 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NESP48681 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NESP48681 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NESP48681 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NESP48681 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms