Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms