Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NF1P21359 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NF1P21359 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NF1P21359 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NF1P21359 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NF1P21359 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms