Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms