Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTAP09496 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTAP09496 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTAP09496 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTAP09496 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms