Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms