Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms