Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI4Q9UM07 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI4Q9UM07 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI4Q9UM07 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI4Q9UM07 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI4Q9UM07 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI4Q9UM07 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PADI4Q9UM07 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI4Q9UM07 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms