Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms