Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BATF3Q9NR55 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms