Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLIRPQ9GZT3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms