Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms