Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FYCO1Q9BQS8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FYCO1Q9BQS8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms