Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms