Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms