Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RB1CC1Q8TDY2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RB1CC1Q8TDY2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RB1CC1Q8TDY2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms