Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX54Q8TDD1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms