Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM179Q6ZVK1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM179Q6ZVK1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM179Q6ZVK1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM179Q6ZVK1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM179Q6ZVK1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms