Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ANKRD54Q6NXT1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms