Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNS3Q68CZ2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms