Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAD1Q5T700 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD1Q5T700 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms