Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms