Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATMQ13315 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATMQ13315 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATMQ13315 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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