Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSG6Q00889 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms