Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 YHR138CYHR138C 345 nt2.15□□□□□ -2.07
HEF3P53978 SNC1YAL030W 354 nt2.15□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.15□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YBR285WYBR285W 435 nt2.15□□□□□ -2.07
HEF3P53978 MKT1YNL085W 2493 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 SWT1YOR166C 1377 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 SMD1YGR074W 441 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YLR287CYLR287C 1068 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YLR334CYLR334C 381 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 RPS18BYML026C 441 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YOR053WYOR053W 342 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 CDC24YAL041W 2565 nt2.14□□□□□ -2.07
HEF3P53978 IST2YBR086C 2841 nt2.13□□□□□ -2.07
HEF3P53978 URM1YIL008W 300 nt2.13□□□□□ -2.07
HEF3P53978 MMS22YLR320W 4365 nt2.13□□□□□ -2.07
HEF3P53978 UBR1YGR184C 5853 nt2.13□□□□□ -2.07
HEF3P53978 DIE2YGR227W 1578 nt2.12□□□□□ -2.07
HEF3P53978 CBS1YDL069C 690 nt2.12□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YER121WYER121W 345 nt2.12□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YPR146CYPR146C 330 nt2.12□□□□□ -2.07
HEF3P53978 TRM3YDL112W 4311 nt2.12□□□□□ -2.07
HEF3P53978 ELG1YOR144C 2376 nt2.12□□□□□ -2.07
HEF3P53978 VPS35YJL154C 2835 nt2.11□□□□□ -2.07
HEF3P53978 IRC20YLR247C 4671 nt2.11□□□□□ -2.07
HEF3P53978 MSL1YIR009W 336 nt2.11□□□□□ -2.07
HEF3P53978 FCF2YLR051C 654 nt2.11□□□□□ -2.07
HEF3P53978 UBC7YMR022W 498 nt2.11□□□□□ -2.07
HEF3P53978 SNC2YOR327C 348 nt2.11□□□□□ -2.07
HEF3P53978 SGD1YLR336C 2700 nt2.11□□□□□ -2.07
HEF3P53978 BUD2YKL092C 3315 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 RPS24BYIL069C 408 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 TMA22YJR014W 597 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 VTI1YMR197C 654 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 MRPL50YNR022C 420 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YPL261CYPL261C 309 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 SFB2YNL049C 2631 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YMR045CYMR045C 5268 nt2.1□□□□□ -2.07
HEF3P53978 COA6YMR244C-A 315 nt2.09□□□□□ -2.07
HEF3P53978 YPL185WYPL185W 396 nt2.09□□□□□ -2.07
HEF3P53978 HSH155YMR288W 2916 nt2.09□□□□□ -2.08
HEF3P53978 RTT107YHR154W 3213 nt2.09□□□□□ -2.08
HEF3P53978 CDC53YDL132W 2448 nt2.09□□□□□ -2.08
HEF3P53978 CRM1YGR218W 3255 nt2.09□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YBL071CYBL071C 309 nt2.08□□□□□ -2.08
HEF3P53978 DAS1YJL149W 1992 nt2.08□□□□□ -2.08
HEF3P53978 RIC1YLR039C 3171 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YLR434CYLR434C 384 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 GPX2YBR244W 489 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 MET18YIL128W 3099 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 MYO4YAL029C 4416 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 SPO22YIL073C 2928 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 BPH1YCR032W 6504 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 NUP192YJL039C 5052 nt2.07□□□□□ -2.08
HEF3P53978 GIM4YEL003W 336 nt2.06□□□□□ -2.08
HEF3P53978 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.06□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.06□□□□□ -2.08
HEF3P53978 BSC3YLR465C 309 nt2.06□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.06□□□□□ -2.08
HEF3P53978 COS111YBR203W 2775 nt2.06□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.05□□□□□ -2.08
HEF3P53978 QCR7YDR529C 384 nt2.05□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YGL069CYGL069C 465 nt2.05□□□□□ -2.08
HEF3P53978 RTT102YGR275W 474 nt2.05□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YAR047CYAR047C 321 nt2.05□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YOR146WYOR146W 306 nt2.05□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YPL238CYPL238C 390 nt2.05□□□□□ -2.08
HEF3P53978 CDC27YBL084C 2277 nt2.04□□□□□ -2.08
HEF3P53978 YOR333CYOR333C 417 nt2.04□□□□□ -2.08
HEF3P53978 VMR1YHL035C 4779 nt2.04□□□□□ -2.08
HEF3P53978 NOT5YPR072W 1683 nt2.03□□□□□ -2.08
HEF3P53978 NUP120YKL057C 3114 nt2.03□□□□□ -2.08
HEF3P53978 RUD3YOR216C 1455 nt2.03□□□□□ -2.08
HEF3P53978 LYS9YNR050C 1341 nt2.03□□□□□ -2.08
HEF3P53978 GNT1YOR320C 1476 nt2.02□□□□□ -2.09
HEF3P53978 DOT6YER088C 2013 nt2.02□□□□□ -2.09
HEF3P53978 YOR029WYOR029W 336 nt2.02□□□□□ -2.09
HEF3P53978 YBR224WYBR224W 516 nt2.02□□□□□ -2.09
HEF3P53978 RTT101YJL047C 2529 nt2.02□□□□□ -2.09
HEF3P53978 VPH1YOR270C 2523 nt2.02□□□□□ -2.09
HEF3P53978 ATG9YDL149W 2994 nt2.02□□□□□ -2.09
HEF3P53978 MNE1YOR350C 1992 nt2.01□□□□□ -2.09
HEF3P53978 STB4YMR019W 2850 nt2.01□□□□□ -2.09
HEF3P53978 ATG31YDR022C 591 nt2.01□□□□□ -2.09
HEF3P53978 HOP2YGL033W 657 nt2.01□□□□□ -2.09
HEF3P53978 HIT1YJR055W 495 nt2.01□□□□□ -2.09
HEF3P53978 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.01□□□□□ -2.09
HEF3P53978 YLR149CYLR149C 2193 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 CAT8YMR280C 4302 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 SNF5YBR289W 2718 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 MNL2YLR057W 2550 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 YDR286CYDR286C 345 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 Q0142Q0142 177 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 YPL182CYPL182C 384 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 TRL1YJL087C 2484 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 AGC1YPR021C 2709 nt2□□□□□ -2.09
HEF3P53978 SMY1YKL079W 1971 nt1.99□□□□□ -2.09
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