Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYKP34925 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RYKP34925 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RYKP34925 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYKP34925 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms