Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX2P28328 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX2P28328 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms