Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL3P19876 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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