Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM10L2BP0DMW5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2BP0DMW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms