Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD3O95983 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD3O95983 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms