Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms