Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRN4Q9NRL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms