Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms