Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms