Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms