Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms