Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms