Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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USP34Q70CQ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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USP34Q70CQ2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP34Q70CQ2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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