Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR2Q2VWA4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKOR2Q2VWA4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKOR2Q2VWA4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms