Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST2H2BEQ16778 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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HIST2H2BEQ16778 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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