Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIP13Q15645 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms