Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms