Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIAQ12857 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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