Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms