Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms