Protein–RNA interactions for Protein: P11142

HSPA8, Heat shock cognate 71 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA8P11142 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPA8P11142 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA8P11142 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms